Phosphoramid Bz-rC

Bz-rC Phosphoramidite là một monome cơ bản để tổng hợp hóa học các oligonucleotide RNA. Nhóm bảo vệ N4‑benzoyl trên nền cytosine ngăn chặn sự phân nhánh và chấm dứt chuỗi trong chu kỳ ghép nối photphoramidite, trong khi nhóm 2′-O‑TBDMS bảo vệ 2′-hydroxyl trong suốt quá trình lắp ráp chuỗi và bị loại bỏ sau khi tổng hợp bằng thuốc thử gốc florua như triethylamine trihydrofluoride (TEA·3HF). Bz-rC Phosphoramidite tương thích với các giao thức tổng hợp RNA tiêu chuẩn trên các máy tổng hợp DNA/RNA tự động (ví dụ: Hệ thống sinh học ứng dụng, MerMade, Dr. Oligo), thường sử dụng dung dịch kích hoạt 0,25 M (5‑ethylthio‑1H‑tetrazole, 4,5‑dicyanoimidazole) và thời gian ghép 5–10 phút. Bz-rC Phosphoramidite đã được xác nhận rộng rãi trong quá trình tổng hợp RNA cho các nghiên cứu cấu trúc, oligonucleotide antisense, siRNA và aptamer. Bz-rC Phosphoramidite cũng được sử dụng làm chất chuẩn đối chiếu trong việc phân tích tạp chất oligonucleotide, vì nhóm benzoyl có thể tạo ra các sản phẩm phụ đặc trưng (ví dụ: các sản phẩm N4‑benzoyl‑depyrimidination) phải được theo dõi trong quá trình phát triển quy trình.

Thông số sản phẩm

Đảm bảo chất lượng tại Cosperpharm

Mỗi đợt trải qua:

● Sắc ký khí (GC) – độ tinh khiết ≥97,0%

● Chuẩn độ không chứa nước – độ tinh khiết ≥97,0%

● Chỉ số khúc xạ – phân tích khẳng định

● ¹H NMR – xác minh cấu trúc

● Ngoại quan – chất lỏng trong suốt không màu đến vàng nhạt đến cam nhạt

COA, MSDS đầy đủ (với thông tin GHS đầy đủ) và giấy chứng nhận xuất xứ đi kèm với mỗi lô hàng.

Câu hỏi thường gặp

Câu hỏi 1: Sự khác biệt giữa Bz-rC Phosphoramidite và Ac‑rC Phosphoramidite là gì?

Đáp: Bz-rC Phosphoramidite sử dụng nhóm bảo vệ benzoyl (Bz) trên amin ngoại vòng N4 của cytosine, trong khi Ac‑rC sử dụng nhóm acetyl (Ac). Nhóm benzoyl cung cấp khả năng bảo vệ tốt hơn chống lại quá trình khử pyrimidine trong điều kiện axit loại bỏ DMT (axit trichloroacetic 3% trong dichloromethane). Đối với hầu hết các ứng dụng tổng hợp RNA, nhóm benzoyl được ưu tiên cho các trình tự dài hoặc giàu deoxycytidine.

Câu hỏi 2: Thời gian ghép được khuyến nghị cho Bz-rC Phosphoramidite trên bộ tổng hợp tiêu chuẩn là bao nhiêu?

Trả lời: Trong điều kiện tổng hợp RNA tiêu chuẩn với chất kích hoạt 0,25 M (ví dụ: 5‑ethylthio‑1H‑tetrazole hoặc 4,5‑dicyanoimidazole), thời gian kết hợp điển hình là 5–10 phút đối với Bz-rC Phosphoramidite. Để tổng hợp các oligonucleotide dài hơn (>40-mer) hoặc hiệu suất cao, việc tối ưu hóa nồng độ chất hoạt hóa và thời gian ghép có thể cải thiện năng suất.

Kịch bản ứng dụng sản phẩm

Tổng hợp 1.RNA Oligonucleotide

Bz-rC Phosphoramidite là khối xây dựng tiêu chuẩn để đưa dư lượng cytidine vào các oligonucleotide RNA tổng hợp để nghiên cứu, chẩn đoán và phát triển điều trị.

2.siRNA Sản xuất

Được sử dụng để kết hợp 2′-OH cytidine vào các chuỗi song công siRNA. Nhóm TBDMS được loại bỏ sau khi tổng hợp, tạo ra RNA nguyên gốc hoàn toàn cho nghiên cứu RNAi.

3. Tổng hợp Antisense Oligonucleotide (ASO)

Các ASO nhắm mục tiêu các bản phiên mã RNA yêu cầu các đoạn RNA (ví dụ: trong các thiết kế bộ tạo khoảng cách). Bz-rC Phosphoramidite cung cấp dư lượng cytidine cần thiết với khả năng kháng nuclease hoàn toàn khi để ở dạng 2′-OH hoặc được biến đổi.

4. Thế hệ Aptamer RNA

Các thư viện aptamer và các ứng cử viên aptamer riêng lẻ được tổng hợp về mặt hóa học bằng cách sử dụng Bz-rC Phosphoramidite để đảm bảo độ chính xác của trình tự và khả năng mở rộng.

5. Chuẩn bị RNA sinh học cấu trúc

Đối với nghiên cứu tinh thể học tia X và NMR, các chuỗi RNA được xác định rõ ràng phải được tổng hợp với độ tinh khiết cao. Bz-rC Phosphoramidite mang lại hiệu quả ghép nối cần thiết và độ sạch khi khử bảo vệ.

6.Tiêu chuẩn tham khảo hồ sơ tạp chất

Là một tạp chất tiềm ẩn trong quy trình trong các dược chất oligonucleotide (ví dụ, dư lượng N4‑benzoyl‑cytidine, các sản phẩm khử bảo vệ không hoàn toàn), Bz-rC Phosphoramidite hoặc các dẫn xuất không được bảo vệ của nó dùng làm chất chuẩn đối chiếu trong các phương pháp HPLC và LC-MS.

Liên hệ với chúng tôi

Bạn đã sẵn sàng đặt hàng Bz-rC Phosphoramidite cho dự án tổng hợp RNA tiếp theo của mình chưa? Nhóm của Cosperpharm luôn sẵn sàng thảo luận về các yêu cầu về độ tinh khiết, nhu cầu về tài liệu và thời gian giao hàng của bạn.